Главная > Области применения

Области применения

Протеомика

  • идентификация известных белков,
  • характеристика новых белков,
  • количественная оценка,
  • программное обеспечение ProteinScape.

Пост-трансляционные модификации белков:

  • гликозилирование белков,
  • фосфорилирование белков,
  • другие модификации,
  • программное обеспечение ProteinScape,
  • визуализация изображений – Imaging MS.

Анализ полиморфизмов ДНК (SNPs). Применение MALDI-TOF масс-спектрометрии для анализа генетических полиморфизмов.

В настоящее время высокопроизводительный подход выявления олигонуклеотидных полиморфизмов (SNP), основанный на реакции минисеквенирования с последующим MALDI-TOF-масс-спектрометрическим исследованием успешно используется для масштабного генотипирования человека.

SNP(Single Nucleotide Polymorphisms) - точечные замены одного нуклеотида в цепи ДНК.

SNPs представляют собой наследуемые генетические варианты (аллели).

Геном человека насчитывает примерно 10 млн SNP.

Точечные полиморфизмы не являются непосредственной и обязательной причиной развития заболевания, но могут обуславливать больший или меньший риск его развития при действии различных факторов.

MALDI-TOF масс-спектрометрия позволяет с высокой точностью определять наличие генетических полиморфизмов и в отличие от других масс-спектрометрических методов не приводит к деградации нуклеиновых кислот и образованию многозарядных ионов в ходе ионизации.

  • Не требуется использование изотопных или флуоресцентных меток.
  • Высокая точность и скорость анализа.

Схема проведения анализа 

Объектом исследования служит образец ДНК, выделенный из венозной крови пациента

Масс-спектрометрический этап

Аналитическая мишень:
AnchorChip 400TF-384 (Bruker Daltonics) Стальной тефлонизированный планшет на 384 образца

Матрица:
3-гидроксипиколиновая кислота
Продукты реакции минисеквенирования наносят на планшет и покрывают раствором
3-гидроксипиколиновой кислоты

 

Принцип метода:
измерение отношения массы заряженных частиц к их заряду.

Результаты измерения представляют собой масс-спектры. По наличию в масс-спектрах продуктов реакции минисеквенирования пиков, соответствующих ионам определенной ожидаемой молекулярной массы, выносят суждение о нуклеотидном контексте в данном положении.

Использование высокоточных методов масс-спектрометрического анализа дает возможность определять как гомозиготные, так и гетерозиготные варианты полиморфизмов в клинических образцах.

Липиды. TLC-MALDI.

Метаболиты:

  • скрининг известных,
  • программное обеспечение ProfileAnalysis,
  • программное обеспечение TargetAnalysis,
  • идентификация de novo,
  • контроль качества продуктов синтеза.

Контроль продуктов питания. Скрининг пестицидов.

Токсикологический анализ.

Фармацевтический контроль:

  • подтверждение наличия соединения,
  • наличие примесей,
  • контроль качества препаратов.