Главная > Системы на базе МС MALDI > Краткая инструкция

Краткая инструкция

Идентификация микроорганизмов на микробиологическом анализаторе BactoSCREEN (Россия)

 

 

 Поскольку вакуум в анализаторе набирается в течение 24 часов после включения, прибор остаётся включённым постоянно.

   

 

рис.1

 

На передней панели инструмента есть единственная кнопка с подсветкой для загрузки и смены плашек и 4 светодиодных лампы (рис.1).

Светящиеся светодиодные лампы справа обозначают (снизу-вверх):
  • включенное электропитание,
  • достаточный для работы вакуум,
  • высокое напряжение и процесс снятия спектров
  • получения результатов.

Загрузка образцов. 

Нажмите кнопку загрузки.
Когда она загорится постоянным зелёным светом (рис.2),
можно открыть круглую крышку и поставить или сменить плашку с образцами (рис.3) в загрузочной камере.
рис. 2

рис.3 

  

рис. 4

Благодаря одному закруглённому углу плашку можно установить только в единственном положении: закруглённый угол плашки будет ближайшим правым к оператору (Рис.4).

Закройте крышку.

Когда мишень будет загружена и крышка закрыта, нажмите кнопку загрузки ещё раз.

С установлением достаточного вакуума свет у кнопки станет мигающим голубым.

Постоянный голубой свет кнопки будет означать, что мишень уже находится в зоне анализа.

 

Управление прибором возможно как с клавиатуры, так и с сенсорного экрана.

Для проведения анализа используется программа BactoSCREEN – ID  (автоматическая идентификация).
Откройте программу  BactoSCREEN-ID, кликнув на иконку на экране монитора. 

 

 

На панели основных команд BactoSCREEN-ID возможно ввести новую плашку-мишень, нажав кнопку

 

 

или выбрать файл интересующей постановки из архива.

 Заполнение плашки.

В строке “ИН мишени” (Идентификационный номер плашки/ мишени), введите название, под которым будет сохранён файл с результатами.

Удобно в названии указать и дату постановки (Рис.5).

Возможно ввести как буквенное, так и числовое обозначение. Если этого не сделать, то программа автоматически выведет дату и время постановки.

Рис.5. Вид схемы плашки/мишени для заполнения. Рамкой красного цвета обозначено поле для введения идентификационного номера.

 

 

 

 

 

 

Для визуального удобства ячейки будут иметь разный фон:

 Нажатие левой клавишей мыши на ячейку плашки выводит табло для заполнения (рис.6).

Если на одной из ячеек вы ставите бактериальный стандарт, то в этом случае надо поставить галочку и отметить ею калибратор. Положение такой ячейки с калибратором выбирается пользователем. Поле этой ячейки окрасится в жёлтый цвет. Ячейки с номерами или названиями образцов окрасятся после заполнения голубым цветом.

 

 

Заполнив плашку/мишень, нажмите для запуска измерения кнопку

При первичном получении бактериального стандарта или при смене бакстандарта вводят его данные (серию калибратора и годность калибратора) в выпадающее табло после нажатия на панели основных команд кнопки “Настройки приложения” (Рис.7). Эти сведения будут в дальнейшем автоматически распечатываться в отчёте самодиагностики и калибровки микробиологического анализатора BactoSCREEN.

 

 

 

 

 

Отображение статуса анализа.

В процессе снятия спектров и проведения идентификации программа будет отображать состояние ячеек в режиме просмотра с цветовой индикацией состояния.
Результат снятия спектра появится в левой половине ячейки, результат идентификации микроорганизма – в правой половине ячейки.
   

 

 

 

Цвет правой половины ячейки свидетельствует о результате идентификации по степени сходства с референсными спектрами в базе данных:

   
 
 
 
 
 
 
 
 
Результаты анализа.
После окончания анализа на экране появляется сообщение ”Анализ выполнен”.
Результаты анализа автоматически будут сохранены в архиве.

 Пример результата анализа в виде состояния ячеек на плашке-мишени представлен на рис.8.

Рис. 8. Результаты анализа полу-ченных спектров и идентификации микроорганизмов при сравнении спектров образцов с референсными.

Нажатие кнопки “Подробно о ячейках” представляет развёрнутый результат идентификации.

 Развёрнутый результат идентификации (Рис. 9).

Поле экрана с результатами разделено на 3 части. В левой части отображается список проанализированных ячеек.

При нажатии левой клавишей мыши на выбранную ячейку в центральной части поля появится изображение полученного белкового спектра исследуемого микроорганизма. 

А в правой части поля приведён результат идентификации.

Сверху расположен результат с наибольшей достоверностью и название идентифицированного микроорганизма.

  Полученные результаты отсортированы по мере убывания достоверности.

Зелёный цвет кружка рядом с названием свидетельствует о достоверной идентификации до вида.

Если нажать левой кнопкой мыши в правом поле на название микроорганизма, то в центральной графической части будет представлено сравнение обработанного экспериментального белкового спектра (сверху) с референсным спектром базы данных (снизу) (Рис. 10).

Зелёным цветом анализируемого спектра выделены пики, совпадающие с базой.
Желтым – пики, не совпадающие с базой по ряду параметров.
Красным – пики, отсутствующие в базе данных.
 
Отчёты.
 
Нажатие на панели основных команд кнопки “Отчёт идентификации” выведет на экран соответствующий отчёт (Рис.11).
При наличии принтера его можно распечатать.

 Верхняя часть отчёта содержит перечень ячеек с названиями/номерами образцов и названия микроорганизмов, определённых в этих образцах с максимальными числовыми значениями достоверности идентификации. Если спектр получить не удалось, по такой ячейке в отчёте будет сообщение “спектр отсутствует”. В нижней части отчёта приведены более детальные результаты анализа по каждой из ячеек.

 

Отчёт самодиагностики и калибровки микробиологического анализатора BactoSCREEN  можно при необходимости вывести на экран, нажав сначала на панели основных команд кнопку “О программе”, а затем  на выпадающем экране нажать кнопку “QC Отчёт”.

На рис. 12 приведён образец отчёта самодиагностики и калибровки прибора. Серия бактериального стандарта и срок его годности будут распечатываться автоматически.

 
Работа с архивом.
Все ранее отснятые эксперименты могут быть доступны для просмотра, для чего необходимо нажать кнопку “Архив” на панели основных команд.

 

На экране появится табло со списком сохранённых файлов (рис.13).

 

Выбрав интересующий файл, его можно открыть, нажав на находящуюся напротив кнопку.

 

Убрать список следует нажатием кнопки "Завершить"в правом верхнем углу окна.
Далее можно работать с выбранным и открытым файлом.