Главная > Системы на базе МС MALDI > Описание методики

Описание методики

1. Е диничная колония первичного посева 

2. Н аносится на мишень прибора 

3. Н а образец наслаивается 1 мкл раствора
матрицы (α-циано-4-гидроксикоричная кислота) 

4. М ишень помещается в прибор 

5. ПО обеспечивает:
  • снятие спектра;
  • обработку полученного спектра;
  • сравнение спектра неизвестного микроорганизма со спектрами из базы данных;
  • идентификацию микроорганизма.

В основе идентификации микроорганизмов с помощью системы MALDI BactoSCREEN лежит получение спектра константных белков неизвестного микроорганизма с помощью MALDI TOF масс-спектрометра и последующее сравнение полученного спектра с базой данных.

Процедура пробоподготовки состоит в перенесении единичной колонии микроорганизмов на мишень прибора и наслоении раствора матрицы (α-циано–4-гидроксикоричная кислота) поверх анализируемого образца. Мишень прибора с нанесенными образцами помещается в масс-спектрометр. С образца снимается суммарный спектр, состоящий из 240 единичных спектров. Суммарный спектр преобразуется в «основной спектр» (набор пиков разных масс), который сравнивается со спектрами базы данных. При сравнении для каждого спектра из базы данных высчитывается коэффициент совпадения со спектром неизвестного микроорганизма. Микроорганизм, чей масс-спектр имеет наибольшее значение данного коэффициента, вносится в таблицу результатов. При этом достоверными считаются результаты, для которых значение коэффициента совпадения выше определенной величины:

  • < 0.5 недостоверный результат;
  • 0.5 – 0.8 – достоверная идентификация до рода;
  • > 0.8  - достоверная идентификация до вида.